研究

パソコン

JMP ボルケーノプロット(Volcano Plot)作成

はじめに 実際にJMPを用いてボルケーノプロットを作成してみました。 Volcano Plot作成 JMPに入っているサンプル<Drosophila Aging>を使用しています。   JMP解説の最新版はJMPによるデータ分析 第3版  ...
パソコン

【BoxPlotR】箱ひげ図をきれいに書く方法(エクセルではなく、Rで簡単に)

はじめに 箱ひげ図は、棒グラフよりも情報量が多く、多くの情報を瞬時に伝えるのに役立ちます。 箱ひげ図を描くには、エクセルなどでも可能ですが、書きたいことが書けなかったり、思い通りになってくれなかったりします。 私も書きたいことが書けず悩んだ...
研究

GSEA 解析までの道のり 一日目【ダウンロード】

はじめに シングルセル解析を行うにあたってデータが返ってきました。 そのため、GSEAを行い、遺伝子二群間の比較を行うこととしました。 GSEA ダウンロード シングルセル解析のデータを用いて、二群間の遺伝子群解析をするためにGSEAを用い...
外科

【オススメ】医学統計 初歩の本【いまさら誰にも聞けない 医学統計の基礎のキソ シリーズ】

はじめに 医学統計(医療統計)は、今まで勉強してこなかった場合難しいですよね。 ただ、論文発表する際はもちろん、論文を読む、理解するだけでも統計学を必要とします。 医学統計は、普通の統計とは少し異なる点もあります。なぜなら実際の患者さんのデ...
研究

検定の選び方【どんな時にどんな解析方法がよいか】

統計解析には、たくさんの種類があります。 検定の種類 どんな時にどんな解析方法がよいか 使用する検定解析したい方法パラメトリックノンパラメトリック独立した2群間の連続変数の比較t検定Mann-Whitney U検定対応する2群間の連続変数の...
健康

新型コロナウイルスの情報 NYの情報も踏まえて備忘録、自分用

新型コロナウイルスの情報を少し入手したので、簡単にまとめておきます。   【症状・経過】 やはり無症状が多い。 重篤化する方は、ほぼほぼ高熱が出る。 咳・熱の症状がメインだが、下痢や頭痛、その他多彩な症状がみられる。(ウイルス疾患は基本的に...
健康

【備忘録】新型コロナウイルス(COVID-19)感染動向の確認

新型コロナウイルスの感染動向を確認できるサイトです。 良いと思いましたので、載せておきます。 こちらで感染動向を確認できます。私は毎日見ていますが、良ければどうぞ。   【私の感染動向の確認のしかた】 ①感染者の動向より死亡数の動向をみてい...
研究

【簡単・初心者用】JMPの使い方【一変量・二変量・カプランマイヤー・単変量・多変量解析】

はじめに 統計でよく使われているソフトJMPの使い方を簡単にまとめます。  患者背景のまとめ  ある因子Xの2群間比較  ある因子Xにおけるカプランマイヤー曲線(生存曲線)  単変量・多変量解析 ちなみに統計の専門ではありません。逆に使い方...
研究

【自粛はいつまで?】集団免疫が付くにはどれくらい時間がかかるか?

外科医を10年しています。感染症の専門ではありませんが、数字を使って簡単に検討してみたいと思います。 はじめに 現在、新型コロナウイルス(COVID-19)の影響で緊急事態宣言が出ました。 新型コロナウイルスは、治療薬が無い上に、強力な感染...
研究

Volcano plot とは? グラフの見方、読み方 【超ざっくり簡単に】

はじめに 今回は、Volcano spotについて勉強したいと思います。 実際グラフをみて難しそうと思いました。 調べても簡単な説明は見つかりませんでした。。 ですので、勉強したことを超簡単に記事にしてみました。 マンガでわかる統計学 素朴...