Rでのエラー解決 「警告: Feature names cannot have underscores (‘_’), replacing with dashes (‘-‘)」

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はじめに

Rでは、間違った部分が存在すると、エラーが生じます。

最初の頃は、そのエラーだけで何日も費やすことがありますので、エラーとその解決策を今後の方のために残していきたいと思います。

R言語とはプログラミング言語の一つです。特に統計解析に強いとされます。さらにDeep learningの分野でも注目を浴びています。

Rでのエラーでよく出会うものを選んで、その原因と解決法を載せていきたいと思います。

Rをはじめよう生命科学のためのRStudio入門

Rのエラー原因 「警告: Feature names cannot have underscores (‘_’), replacing with dashes (‘-‘)」

今回のエラーは、Seuratで解析を行っていた際のエラーです。

出てきたエラーは下記です。

「警告: Feature names cannot have underscores (‘_’), replacing with dashes (‘-‘)」

というエラーメッセージが出たので、同じように困っている方がいればと思い、解決までの方法を記載しておきます。

Rでのエラー解決 「警告: Feature names cannot have underscores (‘_’), replacing with dashes (‘-‘)」

このエラーは、”_”(アンダーバー)が使用されているため起こるエラーになります。

アンダーバーを”-”(ダッシュ)に変更すれば解決します。

変更にはgsub関数を使用すれば全部解決します。

例えば、

data <- gsub(“_”, “-“, data)

文字列の置換に関しては

文字列 | R で文字列の切り出しや置換などの文字列処理を行う方法

など参考にしてみてください。

Rの基本的なことであれば、下記の本がオススメです。

2016年に第3版が出ました。少し古いですが、基本が網羅されています。レビューも高評価。

基本ネットで調べれば出てきますが、本として包括的なテキストを持つことは、便利で私は一冊持っておくのが役立っています。

立ち読みも出来ますので、下記リンクから立ち読みしてみてください。

The R Tips 第3版: データ解析環境Rの基本技・グラフィックス活用集

こちらも高評価かつ新しい本になります。特に初心者におすすめの内容です。

知りたい内容があるか、目次で確認してもらえるので、必要であるか確認してみてください。

Rをはじめよう生命科学のためのRStudio入門

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